В конец самого образа-то религия не позволяет данные добавлять? Как там что-то может сместиться и поехать, если поправить только указатель на файл в файловой таблице и дописать его содержимое в конец ISO. :/
Плюс непосредственно перед или после замененным файлом можно добавить несколько байт со значениями старых оффсетов. Чтобы всю эту демогогию в один клик можно было назад удалить, вернув изначальный нетронутый образ.