А по-моему Сойер либо остался на острове, либо погиб, как и Клэр.
Ещё странно, что Джек в суде сказал, что после крушения самолёта выжило лишь 8 человек, двое из них погибли, отсюда и образовалась Шестёрка Оушеаник. Видимо все остальные (ну то есть 40 с чем-то человек) погибли, либо всё-таки на острове остались, что наиболее вероятно. Поэтому скорее всего Джека и терзала совесть в конце Третьего Сезона. Он знал, что поступил неправильно, бросив всех остальных на острове и хочет туда попасть снова.